Онежское озеро - величина водной площади около 10 тыс. кв. км. Длина по главной оси 250 км, ширина до 90 км. Средняя глубина 30-35 м. Самые большие глубины находятся в северо-западной части и достигают 100-125 м. Берега южной части мало изрезаны. На севере озеро образует ряд губ: Петрозаводскую, Кондопожскую, Уницкую, Повенецкую и др. Губы имеют длину от 20 до 127 км (Повенецкая). В них много островов, каменистых гряд и отдельных выступающих на поверхность камней. Острова большей частью поросли сосновым лесом. Самый большой остров - Б. Климецкий, его площадь около 150 кв. км. Водная растительность развита слабо.

Грунты в основном илисто-песчаные, местами имеются каменистые участки. Замерзает обычно в декабре, вскрывается в мае. В Онежское озеро впадает ряд рек, из них крупнейшие - Водла, Шуя, Суна (последняя знаменита порогами-водопадами Кивач и Гирвас), а вытекает Свирь, соединяющая Онежское и Ладожское озера. Из рыб постоянно обитают: минога ручьевая, озерный лосось, озерная форель, ряпушка, корюшка, щука, окунь, судак, ерш, лещ, плотва, язь, уклейка, бычок-рогатка, бычок-подкаменщик, налим.